雖然石墨坩堝能夠接受很高的溫度，但是在空氣中使用時，狀況可能會略有不同。由于空氣中含有氧氣，而高溫下的石墨會與氧氣反響生成CO和CO2等氣體，然后導致石墨的接連氧化和損壞。因而，當石墨坩堝在高溫下使用時，最好是放置在惰性氣體（如氮氣、氬氣等）環境中，以避免氧氣的氧化作用。